06:46
Comentarii Adauga Comentariu

_ Prima structură a enzimei cheie COVID la temperatura corpului uman

_ Prima structură a cheii Enzima COVID la temperatura corpului uman

Oamenii de știință care studiază o enzimă coronavirus COVID-19 la temperaturi variind de la geros la cald pentru corpul uman au descoperit schimbări structurale subtile care oferă indicii despre cum funcționează enzima. Descoperirile, publicate în IUCrJ, jurnalul Uniunii Internaționale de Cristalografie, ar putea inspira proiectarea de noi medicamente pentru a contracara COVID-19 – și poate ajuta la prevenirea viitoarelor pandemii de coronavirus.

„Niciun studiu anterior nu a a analizat această enzimă importantă de coronavirus la temperatura fiziologică (sau a corpului), a spus Daniel Keedy, biolog structural la Universitatea City din New York (CUNY), care a efectuat studiul în colaborare cu oamenii de știință de la Laboratorul Național Brookhaven al Departamentului Energiei din SUA. .

Majoritatea structurilor până în prezent provin din probe înghețate — departe de temperaturile la care funcționează moleculele în celulele vii. „Dacă lucrezi la temperatură fiziologică, ar trebui să obții o imagine mai realistă a ceea ce se întâmplă în timpul unei infecții reale, pentru că acolo se întâmplă biologia”, a spus Keedy.

În plus, a adăugat el, echipa a folosit temperatura ca instrument. „Învârtind butonul și observând cum reacționează proteina, putem afla despre mecanica sa — cum funcționează fizic.

Descifrarea structurii Mpro

Proteina în cauză este principala protează ( Mpro) al SARS-CoV-2, virusul care provoacă COVID-19. La fel ca toate proteazele, este o enzimă care taie alte proteine. În multe infecții virale, inclusiv COVID-19, celulele infectate produc inițial proteinele funcționale ale virusului ca una singură. lanțul proteic conectat. Proteazele decupează bucățile, astfel încât proteinele individuale să se poată forma și să se asambla în noi copii ale virusului. Găsirea unui medicament care să dezactiveze Mpro ar putea pune frâna COVID-19.

Pentru a studia structura enzimei, cercetătorii au folosit o tehnică numită cristalografie cu raze X la Brookhaven Lab's National Synchrotron Light Source II (NSLS-II). NSLS-II este o facilitate pentru utilizatori DOE Office of Science care produce fascicule strălucitoare de raze X. Strălucind acele x -razele de pe o probă cristalizată a unei molecule biologice pot dezvălui trei-di aranjarea dimensională a atomilor care alcătuiesc molecula.

Studiarea probelor care nu sunt înghețate poate fi o provocare.

„Cu cât temperatura este mai mare, cu atât sunt mai mari șansele ca razele X. va deteriora cristalul", a explicat coautorul studiului Babak Andi, care operează linia de lumina Frontier Macromolecular Crystallography (FMX) a NSLS-II.

"Pentru a minimiza daunele, rotim și mișcăm cristalul liniar pe măsură ce se mișcă. prin raze X. Aceasta distribuie doza de raze X pe toată lungimea cristalului”, a spus el.

El a observat că dimensiunea mică a fasciculului de raze X la NSLS-II face posibilă menținerea fasciculului focalizat. chiar și pe cea mai mică dimensiune a cristalului – o muchie care măsoară 10 până la 20 de milionimi de metru sau mai mică – pe măsură ce se rotește.

„În plus, detectorul FMX și alte sisteme funcționează atât de repede, încât putem colecta un set de date complet în doar 10-15 secunde per probă, cu o calitate suficient de bună pentru a rezolva o structură înainte să apară o deteriorare semnificativă cu raze X.”

De la înghețat la fiziologic

Oamenii de știință au folosit FMX va colecta prima serie de date cristalografice Mpro la cinci temperaturi diferite, variind de la criogenic (-280 grade Fahrenheit) la ceea ce este adesea denumit „temperatura camerei” în cristalografia cu raze X (~39°F) până la fiziologic (98°F). De asemenea, au studiat cristalul la temperatura camerei în condiții de umiditate ridicată. Apoi au introdus datele într-un tip special de simulare pe computer pentru a identifica omul y posibile aranjamente la nivel atomic în fiecare set de condiții.

Rezultatele au evidențiat modificări conformaționale subtile, inclusiv o flexibilitate crescută în părți ale proteinei la temperaturi mai ridicate. Echipa a văzut, de asemenea, unele caracteristici unice pentru enzimă în condiții fiziologice.

Majoritatea modificărilor nu au fost direct în „situl activ” al enzimei – partea care este direct implicată în tăierea altor proteine. În schimb, se aflau în părți ale enzimei mai îndepărtate de acea locație. Dar datele sugerează că aceste site-uri îndepărtate ar putea afecta site-ul activ printr-un fel de mecanism de control de la distanță care este comun în sistemele biologice, a spus Keedy. Dezactivarea chiar și a acestor locații îndepărtate ar putea bloca funcția enzimei.

„Puteți să vă gândiți la Mpro ca la un fel de panglică pliată, alcătuită din două jumătăți identice (formând dimeri) care se leagă împreună într-un mod simetric, ca o strângere de mână”, a spus Keedy. Centrul acestei regiuni de strângere de mână („interfața dimer”) se leagă de site-ul activ printr-o regiune de buclă flexibilă a proteinei.

Așa cum a explicat Keedy, oamenii de știință au descoperit că la temperaturi mai ridicate, „prinderea de „Strângerea de mână” se schimbă — cele două componente își reajustează puțin prinderea. Acest lucru ne spune că, atunci când virusul ne infectează, poate exista un fel de comunicare prin această buclă între interfața dimer și site-ul activ", a spus Keedy. .

Calea către proiectarea medicamentelor

„În acest studiu observăm modificări subtile ale structurii, dar proiectarea medicamentelor depinde de modificări subtile – mai puțin de o miliardime de metru aici, mai puțin de o miliardime de metru acolo”, a remarcat Keedy.

Alte studii au arătat că moleculele mici asemănătoare medicamentelor se pot lega de enzimă în unele dintre locațiile îndepărtate identificate în această nouă lucrare.

„Dacă am putea perfecționa aceste molecule, să le optimizăm, să le elaborăm, să le modificăm, atunci am putea avea potențial un nou punct de sprijin pentru modificarea funcției enzima - nu la locul activ, deoarece în esență toate antiviralele pentru această proteină sunt vizate în prezent, ci la un alt site printr-un mecanism diferit", a spus Keedy. „Descoperirile noastre au creat inspirația pentru explorarea acestei idei.”

Rolul apei

Explorarea enzimei la umiditate ridicată imită, de asemenea, condițiile fiziologice din celulele pline cu apă – și poate furnizează indicii suplimentare pentru a ghida proiectarea medicamentului.

„Pentru aceste studii, după selectarea cristalului pe care dorim să-l studiem, am pus peste el o manșon special pentru a-l împiedica să se usuce”, a spus Babak Andi de la NSLS-II. . „Apoi, când punem proba în linia de radiație pentru colectarea datelor cu raze X, scoatem manșonul și suflam un flux continuu de aer la 99,5% umiditate peste cristal în timp ce colectăm datele.”

Rezultatele au evidențiat molecule de apă specifice care se leagă slab de enzimă, inclusiv una în apropierea site-ului activ, numai în condiții de umiditate ridicată.

„Acele molecule de apă vă oferă un indiciu unde se pot lega inhibitorii”, a spus Andi.

Grupul său a studiat o serie de potențiale molecule asemănătoare medicamentelor care par să înlocuiască moleculele de apă slab legate atunci când se leagă lângă locul activ al lui Mpro. Această activitate este raportată într-o lucrare publicată recent în Scientific Reports din portofoliul de reviste Nature.

Amândoi oameni de știință au fost recunoscători pentru spiritul de colaborare al întregii echipe, care a inclus și oameni de știință suplimentari atât la Brookhaven Lab, cât și la CUNY. , precum și Diamond Light Source din Regatul Unit.

„A fost foarte important să putem avea colaborarea de la distanță pentru ca acest proiect să funcționeze, în care aveam oameni la fața locului la linia de lumină și oameni în afara locației. cine ar putea face modelarea pe computer”, a spus Keedy. „Este un exemplu al multor reuniuni ale comunității științifice în timpul pandemiei.”


(Fluierul)


Linkul direct catre Petitie

CEREM NATIONALIZAREA TUTUROR RESURSELOR NATURALE ALE ROMANIEI ! - Initiativa Legislativa care are nevoie de 500.000 de semnaturi - Semneaza si tu !

Comentarii:


Adauga Comentariu



Citiți și cele mai căutate articole de pe Fluierul:

UK. Conservatorii ar câștiga doar TREI locuri sub Liz Truss dacă alegerile ar avea loc astăzi, în timp ce se apropie furtuna laburistă

_ De la mirosirea stresului la simțirea când minți: iată cât de multe știe câinele tău despre tine

Ce abuzuri face poliția ca să împiedice mitingul din 2 octombrie. George Simion a fost săltat de poliție, la 3 dimineața, din Piața Victoriei

PREZENTUL FĂRĂ PERDEA Marius Oprea / PRIDE la români - marşul trufiei şi al libertăţii de a fi intolerant

Se dezvăluie că „hormonul iubirii” are proprietăți de vindecare a inimii

Progresiștii și Slugile lor au pus la cale cea mai bestială criză energetică pe spinarea oamenilor sărmani. Dan Negru atacă ipocrizia promotorilor energiei verzi: Vin frigul și bezna in Europa! Întrebați-vă dacă noi suntem maimuțe

Piața imobiliară din București bubuie: valoarea terenurilor cumpărate s-a dublat față de 2019!

Ce mai fac neobolșevicii progresiști. Organizația transsexuală de "caritate" a fost investigată după afirmațiile că a trimis dispozitive de aplatizare a sânilor fetelor pe spatele părinților

SUA. Curtea ordonă FBI să producă informațiile pe care le deține legate de laptopul lui Seth Rich în termen de 14 zile

UK. Lira se întoarce: lira sterlină își revine cu greu din pierderi

_ Jucătorii de golf și amatorii celebrități se îndreaptă spre Scoția pentru campionatul anual Alfred Dunhill Links

_ Tensiunile se răsfrâng la evenimentul de tenis Challenger din Franța

_ Oamenii de știință găsesc noi indicatori ai dezghețului permafrostului din Alaska

Le-a luat 1000 de ani și impun o groaza de hârtii și anunțuri ca să facă ceea ce Ceaușescu făcea non-stop fără nici o hartie...Senatul României a decis: Curtea şcolii trebuie să se deschidă pentru sport

_ Sabrina Dhowre Elba îmbracă o rochie neagră drapată la Gala Luminous BFI cu mama ei Maryam Egal

_ Mama surprinsă pe Google Maps stând exact în același loc în Carlisle, la 9 ani

_ Câștigătorul marii finale NRL este decis de MEERKATS în timp ce jucătorii își dezvăluie ritualurile ciudate înainte de joc

_ Acest fard de obraz de 26 GBP este GENIUS pentru tenul matur

_ Tensiunile se răsfrâng la evenimentul de tenis Challenger din Franța

_ Sărbătorile zilei de 30 septembrie

_ M&M�s anunță noul �Spokescandy� Purple care �reprezintă acceptarea și incluziunea�

_ Fostul arhiepiscop de Canterbury cere repatrierea tăbliței etiopiene din Westminster Abbey

_ Woolworths și Big W scapă de o „produsă” majoră de Crăciun în sclipici

_ Conor McGregor nu se va întoarce la UFC timp de șase luni... alimentează zvonurile că ar putea reveni la box

_ Garang Kuol: Newcastle a învins Barcelona pentru a semna o viitoare stea într-un contract de 515.000 de dolari

_ Bărbat mascat în negru, „fata de 10 ani a luat-o în jurul taliei în timp ce se îndrepta spre școală”

_ Ferne McCann „se aburește pe Billie Faiers pentru că i-a dat fiului ei același nume cu fostul ei întemnițat Arthur”

_ Mii de oameni sunt prinși în casele inundate din Florida, în timp ce Ian își recapătă puterea uraganului

_ Real Madrid „își face planuri să-l atragă pe fundașul Man City, Joao Cancelo, la Bernabeu”

_ Sefii din Premier League par gata să continue planurile pentru jocurile stele, în ciuda reacției lui Todd Boehly

_ Lara Worthington arată abdomene super tonifiate și fizic zvelt în timpul unei ședințe foto la Sydney

_ Putin semnează un decret de recunoaștere a două regiuni ucrainene ca state independente după referendumuri false

_ Dua Lipa poartă rochie neagră la evenimentul Fundației Clooney pentru Justiție după întâlnire cu Trevor Noah

_ Regina a murit la 15:10. Deci, de ce a durat mai mult de trei ore pentru a-i spune prințului Harry?

_ EXCLUSIV: Petiție depusă la Curtea Supremă a SUA �mpotriva Dominion, Facebook și CFCL �n �Un caz de mare importanță națională�

_ (P) Impactul digitalizării în managementul resurselor

_ Insarcinata Billie Faiers isi afiseaza umflatura de bebelus intr-un tricou la iesirea cu sotul Greg Shepherd

_ Lula v. Boslonaro: Brazil’s decisive debate on eve of presidential election

_ Cântăreața Britain's Got Talent, care a făcut-o pe Amanda Holden până la lacrimi, a furat 20.000 de lire sterline în numerar pentru teatru

_ Christopher Nkunku „a avut un control medical secret al Chelsea la Frankfurt” înainte de o posibilă mutare de 52,8 milioane de lire sterline în 2023

_ Opt migranţi, prinşi la frontieră ascunşi în maşini transportate pe o platformă; alţi trei, într-un camion

_ Liz Truss este lăsată zguduită de Labour care se ridică la un lider record de 33 de puncte

_ Tatăl lui Stephen Lawrence, Neville, „dezgustat” după ce criminalul rasist David Norris a trimis selfie-uri în închisoare

_ „Iad în culise”: Senatul francez atacă industria porno după scandalul de abuz

_ Live: Putin va găzdui ceremonia de la Kremlin care va anexa patru părți ale Ucrainei

_ Sefii din Premier League par gata să continue planurile pentru jocurile stele, în ciuda reacției lui Todd Boehly

_ Incendiul din biroul electoral din Paraguay distruge mii de aparate de vot

_ Derby-ul a fost mult prea ușor pentru Manchester City recent... dar acesta nu va fi

_ Steve Wright le asigură fanilor că nu se retrage în timp ce se pregătește pentru ultimul spectacol de după-amiază după 23 de ani

_ Dolphins vs Bengals LIVE: Miami neînvins încearcă să-și mențină începutul perfect de sezon

_ Naomi Campbell își poartă lucrurile într-un blazer adânc pe pista Messika în timpul Săptămânii Modei de la Paris

_ EXC: Sam Thompson dezvăluie că Zara McDermott vine acasă în plâns după ce a filmat documente emoționante

_ Tom Brady donează Fondului de dezastre pentru uraganul Ian din Florida

_ EDEN CONFIDENTIAL: Geri Horner îi învinge pe sceptici după ce a câștigat bătălia pentru locuințe

_ ADRIAN THILLS: Oh, da! Rockerii preferati ai lui Adele din Brooklyn s-au întors

_ Croaziera o dată în viață a cuplului de 3.500 de lire sterline se transformă într-o călătorie din iad

_ Calea uraganului Ian ÎN DIRECT: Garda de Coastă salvează 23 de persoane de la o valuri de furtună de 18 metri

_ Trailerul Raymond & Ray îi găsește pe Ewan McGregor și Ethan Hawke ca doi frați înstrăinați

_ Acordul lui Harry Kane cu încălțămintea Nike este suspendat din cauza „fascinației” sportului față de Erling Haaland.

_ Jale pentru românii cu rate: IRRC crește cu 53% față de 2021


Pag.1 Pag.2 Pag.3 Pag.4 Pag.5 Pag.6 Pag.7
Pag.8 Pag.9 Pag.10 Pag.11 Pag.12 Pag.13 Pag.14 Pag.15
Pag.16 Pag.17 Pag.18 Pag.19 Pag.20 Pag.21 Pag.22 Pag.23
Pag.24 Pag.25 Pag.26 Pag.27 Pag.28 Pag.29 Pag.30 Pag.31
Pag.32 Pag.33 Pag.34 Pag.35 Pag.36 Pag.37

Nr. de articole la aceasta sectiune: 2179, afisate in 37 pagini.



ieri 22:04 _ TREBUIE CITITĂ
ieri 21:59 _ THRILLERE
ieri 21:59 _ POPULAR
ieri 21:59 _ DEBUTĂ
ieri 21:09 _ IMAGINA ACESTA
ieri 21:08