15:06
Comentarii Adauga Comentariu

_ Noua tehnică sensibilă și robustă de secvențiere a ARN-ului unicelular depășește concurența

_ Nou sensibil și robust Tehnica de secvențiere a ARN-ului unicelular depășește concurența

Apariția secvențierii ARN-ului unicelular (scRNA-seq) a revoluționat domeniile medicinei și biologiei, oferind capacitatea de a studia funcționarea interioară a mii de celule la o singura data. Dar metodele scRNA-seq sunt limitate de potențialele inexactități în determinarea compoziției celulelor și de amplificarea ineficientă a ADN-ului complementar complementar (ADNc) - un proces prin care un ADN dublu catenar care „completează” ARN-ul monocatenar este generat și replicat de milioane de ori – prin reacția de schimbare a șablonului folosită în mod obișnuit.

Recent, o echipă de cercetare din Japonia, condusă de prof. asistent Shigeyuki Shichino și prof. Kouji Matsushima de la Universitatea de Științe din Tokyo, a dezvoltat o tehnică nouă și îmbunătățită pentru scARN-seq. Noua metodă, amplificarea și secvențierea ADNc în fază solidă asistată de terminator (TAS-Seq), folosește materiale și echipamente simple pentru a furniza date scRNA-seq de mai mare precizie decât tehnologiile actuale utilizate pe scară largă.

„Noastre. tehnica, TAS-Seq, combină sensibilitatea de detectare genetică, robustețea eficienței reacției și acuratețea compoziției celulare pentru a ne permite să captăm informații celulare importante”, spune prof. asistent Shichino. Studiul a fost publicat în Communications Biology pe 27 iunie 2022. Echipa de cercetare a inclus și prof. asociat Satoshi Ueha de la Universitatea de Științe din Tokyo, prof. Taka-aki Sato de la Universitatea din Tsukuba și prof. Shinichi Hashimoto de la Universitatea de Medicină Wakayama .

TAS-Seq folosește o enzimă independentă șablon pentru amplificarea cADN numită transferază terminală (TdT). Dar TdT este greu de manevrat. Pentru a depăși această provocare, echipa de cercetare a inclus fosfatul dideoxinucleotid (ddNTP) ca „terminator” pentru reacția de amplificare a ADNc. „DdNTP spike-in, în special dideoxicitidină fosfat (ddCTP), oprește extinderea excesivă a cozii polyN de către TdT într-o manieră stocastică și reduce foarte mult dificultățile tehnice ale reacției TdT”, explică prof. asistent Shichino.

TAS-Seq folosește, de asemenea, o platformă scRNA-seq bazată pe nanowell/bead-based, care permite izolarea celulelor individuale în probele de țesut, scăzând astfel prejudecățile de eșantionare celulară și îmbunătățind acuratețea datelor despre compoziția celulelor. Echipa de cercetare a verificat apoi eficiența TAS-Seq și a comparat-o cu tehnicile actuale, utilizate pe scară largă, scRNA-seq, 10X Chromium V2 și Smart-seq2, folosind mostre de țesut pulmonar murin și uman. Ei au descoperit că TAS-Seq ar putea nu numai să detecteze mai multe gene în general, ci și să identifice gene mai variabile, în comparație cu platformele majore de scRNA-seq.

Prof. asistent Shichino spune: „Am descoperit că TAS- Seq poate depăși 10X Chromium V2 și Smart-seq2 în ceea ce privește sensibilitatea de detectare a genelor și ratele de abandon al genelor, ceea ce indică faptul că TAS-Seq ar putea fi una dintre cele mai sensibile metode de ARNc de mare debit. Putem detecta gene într-o gamă largă de nivelurile de expresie mai uniform și detectează, de asemenea, factorul de creștere și genele interleukinei mai robust.”

Un avantaj suplimentar al noii metode este că TAS-Seq este mai puțin susceptibil la efectele lotului. Datele TAS-Seq au fost, de asemenea, foarte corelate cu datele citometrice în flux de pe probele de țesut, ceea ce indică faptul că pot genera date de compoziție celulară extrem de precise.

Vorbind despre viitor, prof. asistent Shichino spune: „Avem deja finalizată dezvoltarea TAS-Seq2, o versiune îmbunătățită și optimizată pe scară largă a TAS-Seq. TAS-Seq2 are de 1,5 până la 2 ori mai multă detectare a genelor în celulele splinei de șoarece.” Echipa de cercetare a înființat, de asemenea, ImmunoGenetics, o companie de risc de la Universitatea de Știință din Tokyo, pentru a furniza servicii scRNA-seq folosind TAS-Seq și TAS-Seq2.

scRNA-seq este un instrument important pentru cercetătorii în medicină și biologie. Dezvoltarea TAS-Seq și TAS-Seq2 va duce la descoperirea de noi ținte terapeutice pentru boli și progrese în domeniul „transcriptomiei spațiale”, care se bazează, de asemenea, pe sinteza cADN-ului în fază solidă. De asemenea, va accelera dezvoltarea tehnologiei omice unicelulare, promovând astfel înțelegerea noastră a principiilor biologiei și dezvoltării și progresiei bolii.


(Fluierul)


Linkul direct catre Petitie

CEREM NATIONALIZAREA TUTUROR RESURSELOR NATURALE ALE ROMANIEI ! - Initiativa Legislativa care are nevoie de 500.000 de semnaturi - Semneaza si tu !

Comentarii:


Adauga Comentariu



Citiți și cele mai căutate articole de pe Fluierul:

Marea Britanie. Tembelizarea Progresistă a copiilor face ravagii Băieții să primească lecții despre menstruație și menopauză alături de fete pentru educație sexuală

_ Superstarul australian al fotbalului Sam Kerr își arată clasa în timp ce marchează un gol INCREDIBIL pentru Chelsea

_ Franța este lovită de furtuni mortale de 140 de km/h, ucigând cinci persoane, inclusiv o fată de 13 ani, în vânt puternic uragan

_ Copilul care țipă, benzile desenate și scuipatul care spune atât de multe despre Marea Britanie infantilizată

_ Christina Milian sfârâie în bikini alb în timpul unui fals catwalk pe insula italiană Sardinia

_ Jackie „O” dezvăluie cum a mințit cândva în conacul cântărețului superstar Lionel Ritchie din LA

_ ALISON BOSHOFF: Știri despre vrăjitorul pentru fanii Harry Potter, deoarece JK Rowling „încheie un acord TV pentru spin-off”

_ Banda de geamanduri pe creasta unui val: KATE MUIR recenzii Fisherman's Friends - One And All

_ Les Dawson s-a întors - sau cel puțin Dead Ringer este: PARTICK MARMION's Edinburgh Festival Special

_ Jacqueline Jossa își etalează curbele de invidiat în timp ce se bucură de soare într-o evadare de familie în Marbella

_ Cumpărați pentru a reveni la afaceri? De ce să fii proprietar încă se ridică

_ HOROSCOP Vineri, 19 august – Trei zodii depăşesc azi orice obstacol. Nimic nu le stă în cale

_ Kim Kardashian se face cu Khloe și Kylie Jenner la un eveniment pentru investitorii 818 Tequila

_ JAN MOIR: Sadiq Khan fără spinare mă face să tânjesc după Boris Johnson și mentalitatea lui de tun cu apă

_ �ncepe: TMZ promovează pudra proteică de cricket

_ EDEN CONFIDENTIAL: Filmul Rosamund Pike înseamnă o zi de plată mare pentru colegiul rival din Oxford

_ Skye Wheatley lasă foarte puțin imaginației în timp ce poartă bikini revoltător în Mykonos

_ Kyle Sandilands își dezvăluie chiloții foarte surprinzători

_ Joe Wicks împărtășește o fotografie superbă a soției însărcinate, Rosie, în timp ce se pregătesc să-și urmeze al treilea copil

_ Pete Doherty și Carl Barat, vedetele din The Libertines urcă pe scena din casa spirituală Margate

_ Gemma Owen îl prezintă pe frumusețea Luca Bish calului ei iubit în timp ce un cuplu se reunește după 24 de ore de distanță

_ Guvernul mai strânge un împrumut de 4,9 miliarde de lire sterline în iulie

_ Diane von Furstenberg, 75 de ani, își prezintă fizicul incredibil cu un selfie în costum de baie

_ Iga Swiatek, eliminată în optimile de finală ale turneului de a Cincinnati

_ Lamar Odom primește o procedură dentară de 80.000 de dolari pe 22 de dinți: „Acum am zâmbetul de un milion de dolari”

_ Paul Sperry: Dacă FBI a omis documente sau trimiteri la vizitele anterioare din Mar-a-Lago din declarația pe propria răspundere � FBI a comis fraudă pe tribunal

_ Launderette are jucători retro într-o învârtire: PETER HOSKIN recenzii Arcade Paradise și Rollerdrome

_ Mel Schilling, de la Married At First Sight, anunță data difuzării versiunii britanice a francizei de succes

_ CHRISTOPHER STEVENS recenzii la televizorul de aseară: Să nu râzi niciodată de o fată de pământ cu un ferăstrău zimțat de 5 picioare

_ Biroul lui John Kerry de trimis special prezidențial pentru climă redactează numele fiecărui personal ca răspuns la solicitarea FOIA

_ SUA se declară „îngrijorate” de raidurile israeliene asupra grupărilor pentru drepturile palestinienilor

_ Volodimir Zelenski somează ONU: 'Trebuie să asigure securitatea centralei Zaporojie, demilitarizarea și eliberarea ei de trupele ruse!'

_ Procurorul american din Massachusetts, finanțat de radical Soros, �i amenință pe americanii care se opun mutilării genitale a copiilor � numind opoziția drept �crimă motivată de ură�

_ Nadhim Zahawi dă vina pe Whitehall pentru deficitul de energie și împiedicarea încercărilor de a spori aprovizionarea

_ Ash Barty dezvăluie marele ei regret de pensionare pentru Serena Williams, în timp ce americanul se pregătește să se retragă

_ ALISON BOSHOFF: Știri despre vrăjitorul pentru fanii Harry Potter, deoarece JK Rowling „încheie un acord TV pentru spin-off”

_ Geri Horner „în război cu vecinii după ce a construit un hambar URIAș fără permisiunea de planificare”

_ Paddy McGuinness „a ratat ziua de naștere a copiilor pentru a filma Celebrity Bakeoff”

_ O imagine ciudată cu o ciupercă „zombie” parazită care erupe dintr-o muscă câștigă concursul de fotografii ecologice

_ Greva personalului TfL... dar milioane WFH: Lucrătorii cu autobuze și metrou renunță la Londra pentru a paraliza Londra

_ Samatha Womack dezvăluie că se recuperează după o operație de cancer la sân

_ Kendall Jenner poartă o rochie albă în timp ce primește sprijin de la surori celebre la petrecerea 818 Tequila

_ Luis Suarez îl avertizează pe Darwin Nunez că fundașii îl vor „căuta” după roșul său Crystal Palace

_ Kylie Jenner se aruncă în rochie FOARTE revelatoare participând la petrecerea 818 Tequila a surorii Kendall

_ Faceți cunoștință cu Cute PRIMA UITARE: Pete Davidson și Kaley Cuoco au acel aspect de dragoste pentru comedia romantică Peacock

_ Echipajele de pompieri din Algeria controlează incendiile care au făcut 38 de morți

_ Emma Răducanu eliminată de la Cincinnati, dar optimistă în privinţa jocului ei, înainte de US Open

_ Denise Rifai exultă la gândul că gramatica va deveni subiect de examen: Atât de mulți tineri scriu prost și agramat

_ Rușii le-au cerut angajaților de la centrala nucleară de la Zaporojie să nu meargă vineri la servici (NBC News)

_ Rușii aveau un spion infiltrat în Rada Supremă din Ucraina: oficialii străini au fost spionați și înregistrați/ Video

_ Cod galben și cod portocaliu de caniculă în aproape toată țara: seara vom avea furtuni puternice/ Harta

_ Monty Don este dezactivat de publicul „mafiot” care urmărește Lumea grădinarilor

_ „Cine se distrează mai mult?”: Dame Joan Collins, în vârstă de 89 de ani, se îmbracă cu o perucă blondă în timp ce își lasă șuvițele brunete

_ Apropiatul lui Donald Trump pledează vinovat pentru evaziune și fraudă fiscală: urmează să depună mărturie îmăptriva Trump Organization

_ Recuperarea inundațiilor din Noua Zeelandă se estimează că va dura „ani”

_ Chinezii investesc puternic în Rusia: un gigant auto va produce mașini în fabricile rusești

_ Infractorul sexual din NYC MERGE LIBER după ce acuzațiile de tentativă de omor au fost declasate la contravenție

_ Scandal la Helsinki - Premierul Sanna Marin, dispusă să facă un test antidrog: Nu am nimic de ascuns

_ Karlie Kloss merge șic de afaceri în costum de vară albastru pudra în timp ce se află în orașul New York

_ Antrenorul lui Matildas spune că Sam Kerr este SINGURA alegere pentru a câștiga Balonul de Aur ca cel mai bun jucător din lume


Pag.1 Pag.2 Pag.3 Pag.4 Pag.5 Pag.6 Pag.7
Pag.8 Pag.9 Pag.10 Pag.11 Pag.12 Pag.13 Pag.14 Pag.15
Pag.16 Pag.17 Pag.18

Nr. de articole la aceasta sectiune: 1044, afisate in 18 pagini.



ieri 22:07 _ POPULARĂ
ieri 22:07 _ CONTEMPORANĂ
ieri 22:07 _ IMAGINA ACESTA
ieri 22:07 _ TREBUIE CITIT
ieri 12:22 _ Curs valutar
ieri