19:29
Comentarii Adauga Comentariu

_ Cine este cine dintre bacterii: o modalitate fiabilă de a defini speciile și tulpinile

_ Cine este cine dintre bacterii: o modalitate fiabilă de a defini speciile și tulpinile

Ce este într-un nume? Multe, de fapt. Pentru comunitatea științifică, numele și etichetele ajută la organizarea organismelor lumii astfel încât acestea să poată fi identificate, studiate și reglementate. Dar pentru bacterii, nu a existat niciodată o metodă fiabilă de a le organiza în specii și tulpini în mod coeziv. Este o problemă, deoarece bacteriile sunt una dintre cele mai răspândite forme de viață, reprezentând aproximativ 75% din toate speciile vii de pe Pământ.

O echipă internațională de cercetare a încercat să depășească această provocare, care ia afectat de multă vreme pe oamenii de știință care studiază. bacterii. Kostas Konstantinidis, profesor Richard C. Tucker la Școala de Inginerie Civilă și de Mediu de la Institutul de Tehnologie din Georgia, a condus un studiu pentru a investiga diviziunile naturale ale bacteriilor cu scopul de a determina o metodă viabilă din punct de vedere științific pentru organizarea acestora în specii și tulpini. . Pentru a face acest lucru, cercetătorii au lăsat datele să le arate calea.

Cercetarea lor a fost publicată în revista Nature Communications.

„Deși există o definiție de lucru pentru specii și tulpini, acest lucru este departe de a fi acceptat pe scară largă în comunitatea științifică”, a spus Konstantinidis. „Aceasta se datorează faptului că acele clasificări se bazează pe standardele oamenilor care nu se traduc neapărat bine în tiparele pe care le vedem în mediul natural.”

De exemplu, a spus el, „Dacă ar fi să clasificăm primatele folosind aceleași standarde care sunt folosite pentru a clasifica E. coli, atunci toate primatele - de la lemuri la oameni la cimpanzei - ar aparține unei singure specii."

Există multe motive pentru care un sistem de organizare cuprinzător a fost dificil. pentru a concepe, dar adesea se rezumă la cine primește cea mai mare atenție și de ce. Mai multă atenție științifică duce, în general, la o definire mai restrânsă a acestor bacterii. De exemplu, speciile de bacterii care conțin tulpini toxice au fost studiate pe larg din cauza asocierii lor cu boala și sănătatea.

Acest lucru a fost din necesitatea de a diferenția tulpinile dăunătoare de cele inofensive. Descoperirile recente au arătat, totuși, că chiar și definirea tipurilor de bacterii prin toxicitatea lor este nesigură.

„În ciuda importanței de temelie a conceptelor de specii și tulpini pentru microbiologie, acestea rămân, totuși, prost definite. și confuz”, a spus Konstantinidis.

Echipa de cercetare a colectat bacterii de la două saline din Spania. Sarele sunt structuri construite în care apa de mare se evaporă pentru a forma sare pentru consum. Ele adăpostesc diverse comunități de microorganisme și sunt locații ideale pentru a studia bacteriile în mediul lor natural. Acest lucru este important pentru înțelegerea diversității în populații, deoarece bacteriile suferă adesea modificări genetice atunci când sunt expuse la medii de laborator.

Echipa a recuperat și a secvențiat 138 de izolate aleatorii de bacterii Salinibacter ruber din aceste săruri. Pentru a identifica lacunele naturale în diversitatea genetică, cercetătorii au comparat apoi izolatele cu ei înșiși, folosind o măsurătoare cunoscută sub numele de identitate medie de nucleotide (ANI) - un concept dezvoltat de Konstantinidis la începutul carierei sale. ANI este o măsură robustă a înrudirii dintre oricare doi genomi și este folosită pentru a studia relațiile între microorganisme și viruși, precum și animale. De exemplu, ANI între oameni și cimpanzei este de aproximativ 98,7%.

Analiza a confirmat observațiile anterioare ale echipei că speciile microbiene există și ar putea fi descrise în mod fiabil folosind ANI. Ei au descoperit că membrii aceleiași specii de bacterii au arătat o înrudire genetică, de obicei, variind de la 96 la 100% pe scara ANI și, în general, mai puțin de 85% înrudire cu membrii altor specii.

Datele au relevat un decalaj natural în valorile ANI de aproximativ 99,5% ANI în cadrul speciilor Salinibacter ruber, care ar putea fi utilizat pentru a diferenția specia în diferitele sale tulpini. Într-o lucrare însoțitoare publicată în mBio, echipa a examinat aproximativ 300 de specii bacteriene suplimentare pe baza a 18.000 de genomi care au fost secvenționați recent și au devenit disponibile în bazele de date publice. Ei au observat modele similare de diversitate la mai mult de 95% dintre specii.

„Credem că această lucrare extinde setul de instrumente moleculare pentru a descrie cu acuratețe unități importante de diversitate la nivel de specie și în cadrul speciilor și credem că va beneficiază de viitoarele studii de microdiversitate în medii clinice și de mediu”, a spus Konstantinidis.

Echipa se așteaptă ca cercetarea lor să fie de interes pentru orice profesionist care lucrează cu bacterii, inclusiv biologi evoluționiști, taxonomiști, ecologisti, ingineri de mediu, clinicieni, bioinformaticieni, agenții de reglementare și altele. Este disponibil online prin site-ul web al lui Konstantinidis și GitHub pentru a facilita accesul și utilizarea de către comunitățile științifice și de reglementare.

„Sperăm că aceste comunități vor îmbrățișa noile rezultate și metodologii pentru identificarea mai robustă și mai fiabilă a speciilor. și tulpinile pe care le oferă, în comparație cu practica actuală”, a spus Konstantinidis.


(Fluierul)


Linkul direct catre Petitie

CEREM NATIONALIZAREA TUTUROR RESURSELOR NATURALE ALE ROMANIEI ! - Initiativa Legislativa care are nevoie de 500.000 de semnaturi - Semneaza si tu !

Comentarii:


Adauga Comentariu



Citiți și cele mai căutate articole de pe Fluierul:

_ De la coastă la adâncimea mării, schimbarea nivelului de oxigen afectează viața marine în moduri diferite

_ Euro Area PMI Activity Hits 11 Month High On Service Expansion As Manufacturing Recession Gets Worse

_ Bella Hadid este verificată de Instagram pentru că a postat fotografii cu copii în războiul sirian în timp ce împărtășește sprijinul pentru Palestina: „Gaza în mintea mea”

_ Vânzările de maşini electrice vor creşte în 2024 datorită cererii puternice din China

_ Senatul SUA va vota pachetul de ajutor pentru Ucraina după întârzierea de luni de zile a Camerei

_ Landfill fire envelops New Delhi in smoke

_ A cincea boală a copilăriei: Boala obrajilor pălmuiți sau eritemul infecțios

_ Cu cât împrumutul pentru studenți este mai mare, cu atât sunt mai mici șansele de a obține note bune

_ Tot ce poate merge prost cu sânii tăi - și ce să faci în privința asta: ghidul definitiv al DR PHILIPPA KAYE

_ Armata Română a rămas fără ofiţeri. Are încadrate doar 57 la sută din funcţii

_ SCOTUS va audia un proces care contestă regula ATF „Ghost Gun” a lui Biden înainte de alegeri

_ MAI MULTĂ NEBUNIE TREIZĂ: NPR are un avertisment declanșator cu privire la Declarația de independență

_ Ce a făcut Kadîrov după ce s-a anunţat că e pe moarte

_ Large Structural Short Will Drive Yen Much Higher

_ Necesitatea urgentă de remediere a lacunei forestiere în Parcul Național Marele Koala propus

_ ROMGAZ, cel mai mare producător și furnizor de gaze naturale din România, devine Membru Asociat al ARIR

_ Reacţii politice la decizia PSD-PNL privind retragerea candidaturii lui Cătălin Cîrstoiu la Primăria Capitalei

_ Mama care și-a dus copilul de un an la COACHELLA dezvăluie cum a fost într-adevăr să participi la festivalul plin cu un bebeluș - și reacțiile foarte surprinzătoare pe care le-a primit de la străini

_ Tom Holland are o vânătaie după ce „a fost lovit la cap cu o minge de golf” în timp ce juca o rundă la St Andrews

_ Kate Middleton este onorată de Rege pentru anii de serviciu public: Prințesa de Wales devine primul membru al familiei regale care este numit însoțitor regal al Ordinului Companionilor de Onoare

_ Gindrovel Dumitra: Neîncrederea în vaccinare e un fenomen sociologic

_ Ce este „voce CULT”? Fosta mormonă dezvăluie felul în care tonul ei de vorbire s-a schimbat complet în timp ce trăia în secta ultra-religioasă - recunoscând că sună „de nerecunoscut” de când a fugit din comunitate.

_ Fostul lider al Hells Angels dezvăluie consecințele înfricoșătoare cu care s-a confruntat pentru RENUNȚAREA grupului de motocicliști violenti după 40 DE ANI - în timp ce ridică capacul despre cum era cu adevărat să trăiești ca un haiduc

_ Doi tineri fugiți din calea războiului, în hipotermie, de câteva zile în munții Maramureșului

_ Transportul materialelor periculoase în toată țara nu este ușor - de aceea există o serie de reglementări în vigoare

_ Petrol surpasses 150p a litre - cost of filling up is now at a five-month high

_ Ionuț Stroe, despre decizia coaliției și șansele lui Sebastian Burduja la Primăria Capitalei: 'Nu va fi complicat / Are șanse foarte mari'

_ PRINS! Șeful DEI UCLA care a condus studenții �n c�ntecul �Palestina liberă� a fost surprins �n timp ce plagia 10 lucrări �n doctoratul ei. Disertație

_ Luptătorul taliban care a condus un stand de piață ca front pentru a recruta extremiști și a ucide trupele britanice ar putea fi eliberat din închisoare după ce i s-a acordat astăzi audierea de eliberare condiționată

_ Turcia spune că Irakul consideră că trebuie să elimine miliția kurdă PKK

_ Premierul francez susține școlile-internat pentru a combate „dependența de violență” a tinerilor

_ Armenia și Azerbaidjan încep să stabilească granița comună după un conflict de decenii

_ Lovituri aeriene în Gaza. Israelienii susţin că au atacat poziţii de lansare Hamas

_ Sfântul Gheorghe, ocrotitorul Armatei Române, tradiţii şi superstiţii. Ce nu e recomandat să faci pe 23 aprilie

_ Kolanovic spune că „corecțiile mai sunt de făcut”, în timp ce biroul de tranzacționare al JPM rămâne „optimist”

_ „Amenințarea cu care se confruntă țara noastră este din extrema stângă” și bătăuși socialiști, nu Trump: Bill Barr

_ Legătura specială a Suri Cruise cu mama Katie Holmes este expusă pe deplin în timp ce ea iese pentru prima dată de la împlinirea a 18-a... după ce tatăl scientologist Tom Cruise a ignorat reperul

_ Asia most disaster-hit region by climate change in 2023

_ Ucraina suspendă serviciile consulare de peste mări pentru bărbații de vârstă militară

_ Nava de marfă Dali care s-a prăbușit în podul Francis Scott Key din Baltimore a fost „nepotrivită” cu o sursă de energie scăzută și un echipaj neinstruit, susține procesul-bombă

_ Noul nanocompozit din deșeurile de coajă de papaya prezintă activitate fotocatalitică și antibacteriană promițătoare

_ Biden's America: 40% Of Renters Think They'll Never Own A Home, Up From 27% Last Year

_ „Lasă-mă să merg acasă, bine?”: A fost anulată procesul pentru fermierul din Arizona, acuzat de uciderea imigrantului ilegal pe proprietatea sa

_ Surf este în sus... și în sus și în sus: surferul german Sebastian Steudtner a revendicat recordul mondial după ce a călărit un val de 93,7 ft „nesurfabil” în Portugalia

_ Rafila: Registrele de boli fundamentează politicile de sănătate şi alocarea de fonduri

_ Bani fără taxe! Veniturile încasate de ONG-urile din România au sărit de 21 de miliarde de lei!

_ MeerKAT: Radiotelescopul sud-african care ne-a transformat înțelegerea cosmosului

_ Mister în timp ce rapperul mexican Bela Rush, în vârstă de 33 de ani, este găsită moartă la patru săptămâni după ce a dispărut, mulți dintre fanii ei sugerând joc nelegiuit și polițiștii rămân tăcuți cu privire la cauza morții ei.

_ Călătorii de sărbătorile bancare se confruntă cu haos, în timp ce sute de lucrători de la Heathrow intră în grevă pentru o săptămână întreagă, în dispută cu privire la externalizarea locurilor de muncă

_ După ce a provocat un scandal uriaș în Parlament, Boloș pune rezultatele vizitei în SUA pe masă - vești bune pentru România

_ Moment O navă Carnival Cruise Line salvează 27 de imigranți blocați într-o barcă mică de lemn, la 20 de mile în largul coastei Cubei

_ Marea Britanie stârnește scandal mondial, cu o lege votată noaptea!

_ Cel mai îndepărtat obiect fabricat de oameni transmite din nou din cosmos către Pământ

_ Iohannis a anunțat cine are șanse la Primăria Capitalei: ‘El e un candidat redutabil’

_ Cu girul primit de la Iohannis, Burduja a început în forță bătălia pentru Primăria Capitalei: 'Mergem înainte!'

_ Horoscopul zilei de 24 aprilie 2024. Berbecii trec la schimbări majore în viața lor

_ Luis Rubiales va compărea în faţa instanţei după respingerea apelului său

_ Acord de cooperare în domeniul apărării, semnat de România şi Coreea de Sud

_ Ion Cristoiu: De ce au eşuat ziariştii-vedetă intraţi în politică

_ Liderii UE încearcă să convingă Grecia și Spania să își „sacrifice” propriile apărări antiaeriene pentru Ucraina


Pag.1 Pag.2 Pag.3 Pag.4 Pag.5 Pag.6 Pag.7
Pag.8 Pag.9 Pag.10 Pag.11 Pag.12 Pag.13 Pag.14 Pag.15
Pag.16 Pag.17 Pag.18 Pag.19 Pag.20 Pag.21 Pag.22 Pag.23
Pag.24 Pag.25 Pag.26 Pag.27 Pag.28 Pag.29 Pag.30 Pag.31
Pag.32 Pag.33 Pag.34

Nr. de articole la aceasta sectiune: 2019, afisate in 34 pagini.